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Ces trésors d'avifaune sont les plus connus mais ne sont pas les seuls. Ils ont été placés, comme la flore, sous la surveillance du Conservatoire du Littoral représenté sur place par l'association Finocchiarola-Pointe du Cap Corse . A côté de cette Zone d'intérêt communautaire pour les oiseaux (ZICO), le Cap Corse a la particularité d'abriter, d'autres petits êtres ailés, plutôt inattendus : 15 espèces de chauves-souris (sur les 22 présentes en Corse) y sont répertoriées. Elles peuplent les galeries des anciennes mines (Luri, Meria, Ersa, Canari) et la grotte de Cudrone (Sisco). Cette dernière constitue l’un des gîtes d'hibernation les plus importants de Corse. Plus à la lumière, les zones humides et le maquis capcorsins, classés en Zone naturelle d’intérêt écologique, faunistique et floristique (ZNIEFF), abritent, batraciens et reptiles endémiques dont le discoglosse sarde, un crapaud qui se régale des petites flaques, ou le lézard tiliguerta, adepte des crêtes rocheuses.